A Escola Superior Agrária dispõe, nas suas instalações, das seguintes infraestruturas de apoio:

• Centro de Investigação em Zoonoses (Clínica Veterinária licenciada com o número PT 2 0135 CL)
• Centro de Biotecnologia de Plantas da Beira Interior
• Biblioteca
• Laboratórios:
  • Biologia
  • Parasitologia
  • SIG/CAD
  • Microbiologia
  • Protecção Vegetal
  • Solos e Fertilidade
  • Reprodução Animal
  • Nutrição e Alimentação Animal
  • Tecnologia Alimentar 
  • Águas e Águas Residuais
• Estação de referência GPS

Na Quinta da Senhora de Mércules (166 ha), onde está instalada, a ESA dispõe de:

• Parque de máquinas com diferentes oficinas
• Estufas de horticultura e floricultura
• Pomares, Olival com 50 ha e vinha experimental
• Vacaria para 30 vacas leiteiras (Unidade Técnica - Bovinicultura)
• Estábulo para engorda de novilhos
• Ovil para 300 ovelhas (Unidade Técnica - Ovinicultura e Caprinicultura)
• Picadeiro (Unidade Técnica - Equinicultura)
• Suinicultura em extensivo (Unidade Técnica - Suinicultura )
• Área de sequeiro e área de regadio
• Parque botânico  com cerca de 4000 árvores em 22 ha
• Arboreto com cerca de 440 árvores de espécies diferentes
• Viveiro florestal com uma estufa de ambiente controlado
• Posto Meteorológico

Além das estruturas de apoio referidas anteriormente a ESA dispõe ainda de:

• Complexo Desportivo (Campos de Futebol/Rugby, Ténis, Polivalente), Pista de Atletismo, Circuito de manutenção, Circuito BTT.